EDI-einingin samanstendur af til skiptis lögum af katjónaskiptahimnum, anjónaskiptahimnum og jónaskiptaresínum, sem mynda himnustafla uppbyggingu með afsöltunar- og þykknihólfum til skiptis. Undir DC spennu flytja katjónir og anjónir í vatninu til samsvarandi rafskauta þeirra: katjónir streyma í gegnum katjónaskiptahimnuna inn í þykknihólfið en eru stíflaðar af anjónaskiptahimnunni en anjónir streyma í gegnum anjónaskiptahimnuna en lokast af katjónaskiptahimnunni og ná þannig sértækri jónasöfnun.
Blandað plastefni rúmið í afsöltunarhólfinu nær kraftmikilli hreinsun með þremur samverkandi áhrifum: Í fyrsta lagi aðsogar það óhreinindi jónir úr vatninu með jónaskiptum; síðan, knúin áfram af rafsviði, flytjast aðsoguðu jónirnar í þykknihólfið; samtímis, H⁺ og OH⁻ sem myndast við rafgreiningu vatnssameinda endurnýja plastefnið stöðugt og viðhalda skiptingargetu þess. Þessi sjálf-endurnýjunarbúnaður útilokar þörfina fyrir kerfislokun fyrir endurnýjun efna.